选mysql适合结构化数据、强一致性和复杂查询，如电商、金融系统；选MongoDB适合灵活 schema、高并发写入和分布式扩展，如日志、iot、内容管理；根据项目需求和团队能力权衡，二者可并存互补。
选MongoDB还是MySQL，关键看你做什么项目、数据怎么用。两者设计思路完全不同，没有绝对好坏，只有适不适合。
数据结构：结构化还是灵活扩展
如果你的数据是表格型的，比如用户信息、订单记录、财务流水，字段固定、关系明确，MySQL 更合适。它是关系型数据库，支持外键、事务、复杂查询，适合需要强一致性的系统，像电商后台、银行系统。
而如果你的应用数据结构经常变，比如内容管理、日志、社交动态、IoT设备数据，mongodb 更灵活。它存的是类似JSON的文档，字段可以随时增减，不用改表结构，开发起来更自由。
读写性能和扩展方式
MySQL 在单机环境下表现稳定，支持复杂的JOIN和事务操作，适合读多写少、查询逻辑复杂的场景。但数据量大了以后，垂直扩展有限，要靠分库分表来撑，复杂度高。
MongoDB 天生为分布式设计，支持自动分片（sharding），水平扩展更容易。写入大量非结构化数据时性能更好，比如实时日志收集、高并发写入场景。但它不支持多文档事务（早期版本限制，现在有部分支持），复杂关联查询也不如MySQL方便。
团队技能和生态工具
MySQL 成熟多年，社区大，资料多，各种管理工具、监控方案齐全，运维门槛相对低。大多数后端框架都默认支持MySQL，招聘懂的人也多。
MongoDB 工具链也不错，尤其在node.js、python这类现代开发栈中集成顺畅。但对事务、一致性要求高的业务，需要团队理解其使用边界，避免误用导致数据问题。
简单说：要稳定、强一致、复杂查询，选MySQL；要灵活、高并发写入、快速迭代，考虑MongoDB。很多公司其实两个都用，不同场景各取所长。基本上就这些。